研究人员用小鼠来展示他们治疗卵巢癌的创新精准医学方法。此外,揭示这些弱点的细胞行为在大多数癌症中都很常见,这意味着这些算法可能为各种癌症产生优越的治疗计划。
密歇根大学生物医学工程博士研究员Abhinav Achreja和生物医学工程博士副教授Deepak Nagrath在北校园研究中心(NCRC)的生物工程实验室从事卵巢癌细胞研究。信
"这可能会彻底改变精准医疗领域,因为靶向药物只会影响和杀死癌细胞,而放过正常细胞,"密歇根大学生物医学工程副教授、发表在《自然-代谢》上的这项研究的高级作者Deepak Nagrath说。"大多数抗癌药物会影响正常组织和细胞。然而,我们的策略允许具体针对癌细胞"。
这种方法被称为附带致死性,它涉及利用从癌细胞抛弃的基因中获得的信息来识别其弱点。人体配备了各种防御癌症的措施。癌细胞过去有抑制性基因,防止它们扩散。然而,这些细胞有一个聪明的应对策略;它们只是删除了包含这些抑制基因的一部分DNA。
在这样做时,细胞通常会失去其他生存所需的基因。为了避免死亡,细胞会找到一个类似物--可以发挥类似功能的基因。通常,有一个或可能有两个基因可以介入并执行相同的功能以保持细胞的活力。
如果医学家能确定正确的类属基因,并以关闭其对细胞的重要功能的方式将其作为目标,会怎么样呢?
"当没有被删除的代谢基因的直接替代物时,我们的算法使用癌细胞代谢的数学模型来预测它们可能使用的旁系代谢途径,"U-M生物医学工程的研究员和研究论文的主要作者Abhinav Achreja说。"这些代谢途径对癌细胞很重要,可以有选择地将其作为目标"。
攻击代谢途径本质上是关闭了细胞的能量来源。在检查卵巢癌细胞时,马萨诸塞州大学的研究小组将目标锁定在一个基因上,即UQCR11,该基因经常与一个抑制性基因一起被删除。UQCR11在细胞呼吸中起着至关重要的作用--细胞为了生存而分解葡萄糖获得能量。
这一过程的紊乱会导致线粒体中一种重要的代谢物NAD+的严重失衡,而线粒体是细胞进行呼吸的地方,尽管困难重重,卵巢癌细胞仍然依靠它们的备份计划而继续茁壮成长。
马萨诸塞大学的算法正确地梳理了多种选择,并成功地预测出缺少UQCR11的细胞将转向基因MTHFD2作为其NAD+的备份供应一方。
印第安纳大学医学院的研究人员在实验室中帮助验证了这些发现。这个由医学教授Xio
ngbin Lu领导的团队开发了带有缺失的卵巢癌的基因改造细胞和动物模型。测试的六只小鼠中,有六只显示出癌症大大缓解的情形。